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2d5a3d934c
2 changed files with 108 additions and 0 deletions
42
GRI30-Prager/insertTranlib.py
Executable file
42
GRI30-Prager/insertTranlib.py
Executable file
|
|
@ -0,0 +1,42 @@
|
|||
#!/usr/bin/python
|
||||
#
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||||
import os
|
||||
import sys
|
||||
import argparse
|
||||
|
||||
import subprocess as sp
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||||
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||||
parser = argparse.ArgumentParser(description='Optional app description')
|
||||
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||||
# Switch
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parser.add_argument('--overwrite', action='store_true',
|
||||
help='write to transport file')
|
||||
|
||||
parser.add_argument('tranlib',
|
||||
help='CHEMKIN transport data file')
|
||||
|
||||
parser.add_argument('foamTransport',
|
||||
help='OpenFOAM transport data file')
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||||
|
||||
args = parser.parse_args()
|
||||
|
||||
print args.overwrite
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||||
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||||
foamTranFile = args.foamTransport
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||||
|
||||
tranlibFileName = args.tranlib
|
||||
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||||
FNULL = open(os.devnull, 'w')
|
||||
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||||
with open(tranlibFileName) as tranlibFile:
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||||
for line in tranlibFile:
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||||
name = line[:19].strip(" ")
|
||||
params = "( {} );".format(line[19:70])
|
||||
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||||
call_state = sp.call(["foamDictionary", "-entry", name, foamTranFile] , stdout=FNULL, stderr=FNULL)
|
||||
|
||||
if call_state == 0:
|
||||
print "touching ", name, "..."
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||||
sp.check_call(["foamDictionary", "-entry", name+".transport.tranlib", "-set", params, foamTranFile], stdout=FNULL, stderr=FNULL)
|
||||
|
||||
|
|
@ -30,6 +30,7 @@ H2
|
|||
diameter 2.92;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 0.455;
|
||||
tranlib ( 1 38 2.92 0 0.79 280 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -58,6 +59,7 @@ H
|
|||
diameter 2.05;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 0.281;
|
||||
tranlib ( 0 145 2.05 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -86,6 +88,7 @@ O
|
|||
diameter 2.75;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 0.678;
|
||||
tranlib ( 0 80 2.75 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -114,6 +117,7 @@ O2
|
|||
diameter 3.407;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.131;
|
||||
tranlib ( 1 107.4 3.458 0 1.6 3.8 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -142,6 +146,7 @@ OH
|
|||
diameter 2.75;
|
||||
dipoleMoment 1.66;
|
||||
dipolePolarizability 0.743;
|
||||
tranlib ( 1 80 2.75 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -170,6 +175,7 @@ H2O
|
|||
diameter 2.605;
|
||||
dipoleMoment 1.844;
|
||||
dipolePolarizability 1.053;
|
||||
tranlib ( 2 572.4 2.605 1.844 0 4 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -198,6 +204,7 @@ HO2
|
|||
diameter 3.458;
|
||||
dipoleMoment 2.2;
|
||||
dipolePolarizability 1.489;
|
||||
tranlib ( 2 107.4 3.458 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -226,6 +233,7 @@ H2O2
|
|||
diameter 3.458;
|
||||
dipoleMoment 2.2;
|
||||
dipolePolarizability 1.773;
|
||||
tranlib ( 2 107.4 3.458 0 0 3.8 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -254,6 +262,7 @@ C
|
|||
diameter 2.75;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.286;
|
||||
tranlib ( 0 71.4 3.298 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -282,6 +291,7 @@ CH
|
|||
diameter 2.75;
|
||||
dipoleMoment 1.5;
|
||||
dipolePolarizability 1.745;
|
||||
tranlib ( 1 80 2.75 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -310,6 +320,7 @@ CH2
|
|||
diameter 3.746;
|
||||
dipoleMoment 0.6;
|
||||
dipolePolarizability 1.654;
|
||||
tranlib ( 1 144 3.8 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -334,6 +345,7 @@ CH2(S)
|
|||
As 9.49616e-07;
|
||||
Ts 177.057;
|
||||
dipolePolarizability 2.009;
|
||||
tranlib ( 1 144 3.8 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -362,6 +374,7 @@ CH3
|
|||
diameter 3.746;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.897;
|
||||
tranlib ( 1 144 3.8 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -390,6 +403,7 @@ CH4
|
|||
diameter 3.746;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 2.6;
|
||||
tranlib ( 2 141.4 3.746 0 2.6 13 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -418,6 +432,7 @@ CO
|
|||
diameter 3.65;
|
||||
dipoleMoment 0.112;
|
||||
dipolePolarizability 1.95;
|
||||
tranlib ( 1 98.1 3.65 0 1.95 1.8 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -446,6 +461,7 @@ CO2
|
|||
diameter 3.763;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 2.65;
|
||||
tranlib ( 1 244 3.763 0 2.65 2.1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -474,6 +490,7 @@ HCO
|
|||
diameter 3.59;
|
||||
dipoleMoment 2;
|
||||
dipolePolarizability 2.138;
|
||||
tranlib ( 2 498 3.59 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -502,6 +519,7 @@ CH2O
|
|||
diameter 3.59;
|
||||
dipoleMoment 2.33;
|
||||
dipolePolarizability 2.292;
|
||||
tranlib ( 2 498 3.59 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -530,6 +548,7 @@ CH2OH
|
|||
diameter 3.69;
|
||||
dipoleMoment 1.5;
|
||||
dipolePolarizability 2.551;
|
||||
tranlib ( 2 417 3.69 1.7 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -558,6 +577,7 @@ CH3O
|
|||
diameter 3.69;
|
||||
dipoleMoment 2;
|
||||
dipolePolarizability 2.669;
|
||||
tranlib ( 2 417 3.69 1.7 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -586,6 +606,7 @@ CH3OH
|
|||
diameter 3.69;
|
||||
dipoleMoment 1.7;
|
||||
dipolePolarizability 2.786;
|
||||
tranlib ( 2 481.8 3.626 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -614,6 +635,7 @@ C2H
|
|||
diameter 4.1;
|
||||
dipoleMoment 0.7;
|
||||
dipolePolarizability 2.974;
|
||||
tranlib ( 1 209 4.1 0 0 2.5 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -642,6 +664,7 @@ C2H2
|
|||
diameter 4.1;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 2.867;
|
||||
tranlib ( 1 209 4.1 0 0 2.5 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -670,6 +693,7 @@ C2H3
|
|||
diameter 4.1;
|
||||
dipoleMoment 0.7;
|
||||
dipolePolarizability 3.395;
|
||||
tranlib ( 2 209 4.1 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -698,6 +722,7 @@ C2H4
|
|||
diameter 4.05;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 3.584;
|
||||
tranlib ( 2 280.8 3.971 0 0 1.5 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -726,6 +751,7 @@ C2H5
|
|||
diameter 4.32;
|
||||
dipoleMoment 0.3;
|
||||
dipolePolarizability 3.746;
|
||||
tranlib ( 2 252.3 4.302 0 0 1.5 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -754,6 +780,7 @@ C2H6
|
|||
diameter 4.32;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 4.036;
|
||||
tranlib ( 2 252.3 4.302 0 0 1.5 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -782,6 +809,7 @@ HCCO
|
|||
diameter 3.97;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 3.631;
|
||||
tranlib ( 2 150 2.5 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -810,6 +838,7 @@ CH2CO
|
|||
diameter 3.97;
|
||||
dipoleMoment 1.42;
|
||||
dipolePolarizability 3.631;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -834,6 +863,7 @@ HCCOH
|
|||
As 1.42053e-06;
|
||||
Ts 453.172;
|
||||
dipolePolarizability 3.596;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -858,6 +888,7 @@ N
|
|||
As 1.34918e-06;
|
||||
Ts 122.91;
|
||||
dipolePolarizability 1.081;
|
||||
tranlib ( 0 71.4 3.298 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -881,6 +912,7 @@ NH
|
|||
{
|
||||
As 2.1351e-06;
|
||||
Ts 127.828;
|
||||
tranlib ( 1 80 2.65 0 0 4 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -905,6 +937,7 @@ NH2
|
|||
As 2.2056e-06;
|
||||
Ts 127.828;
|
||||
dipolePolarizability 1.401;
|
||||
tranlib ( 2 80 2.65 0 2.26 4 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -929,6 +962,7 @@ NH3
|
|||
As 1.60775e-06;
|
||||
Ts 502.141;
|
||||
dipolePolarizability 1.634;
|
||||
tranlib ( 2 481 2.92 1.47 0 10 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -953,6 +987,7 @@ NNH
|
|||
As 1.46438e-06;
|
||||
Ts 122.91;
|
||||
dipolePolarizability 2.026;
|
||||
tranlib ( 2 71.4 3.798 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -977,6 +1012,7 @@ NO
|
|||
As 1.58238e-06;
|
||||
Ts 139.283;
|
||||
dipolePolarizability 1.285;
|
||||
tranlib ( 1 97.53 3.621 0 1.76 4 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1001,6 +1037,7 @@ NO2
|
|||
As 1.98953e-06;
|
||||
Ts 231.294;
|
||||
dipolePolarizability 2.21;
|
||||
tranlib ( 2 200 3.5 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1025,6 +1062,7 @@ N2O
|
|||
As 1.61741e-06;
|
||||
Ts 264.864;
|
||||
dipolePolarizability 2.378;
|
||||
tranlib ( 1 232.4 3.828 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1049,6 +1087,7 @@ HNO
|
|||
As 1.70043e-06;
|
||||
Ts 153.722;
|
||||
dipolePolarizability 1.753;
|
||||
tranlib ( 2 116.7 3.492 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1073,6 +1112,7 @@ CN
|
|||
As 1.33729e-06;
|
||||
Ts 124.865;
|
||||
dipolePolarizability 2.803;
|
||||
tranlib ( 1 75 3.856 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1097,6 +1137,7 @@ HCN
|
|||
As 1.3049e-06;
|
||||
Ts 526.585;
|
||||
dipolePolarizability 2.126;
|
||||
tranlib ( 1 569 3.63 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1121,6 +1162,7 @@ H2CN
|
|||
As 1.32901e-06;
|
||||
Ts 526.585;
|
||||
dipolePolarizability 2.595;
|
||||
tranlib ( 1 569 3.63 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1144,6 +1186,7 @@ HCNN
|
|||
{
|
||||
As 3.74158e-06;
|
||||
Ts 182.436;
|
||||
tranlib ( 2 150 2.5 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1168,6 +1211,7 @@ HCNO
|
|||
As 1.59916e-06;
|
||||
Ts 264.864;
|
||||
dipolePolarizability 3.226;
|
||||
tranlib ( 2 232.4 3.828 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1192,6 +1236,7 @@ HOCN
|
|||
As 1.59916e-06;
|
||||
Ts 264.864;
|
||||
dipolePolarizability 2.826;
|
||||
tranlib ( 2 232.4 3.828 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1216,6 +1261,7 @@ HNCO
|
|||
As 1.59916e-06;
|
||||
Ts 264.864;
|
||||
dipolePolarizability 2.863;
|
||||
tranlib ( 2 232.4 3.828 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1240,6 +1286,7 @@ NCO
|
|||
As 1.58032e-06;
|
||||
Ts 264.864;
|
||||
dipolePolarizability 2.679;
|
||||
tranlib ( 1 232.4 3.828 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1268,6 +1315,7 @@ N2
|
|||
diameter 3.652;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.76;
|
||||
tranlib ( 1 97.53 3.621 0 1.76 4 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1291,6 +1339,7 @@ AR
|
|||
{
|
||||
As 2.09517e-06;
|
||||
Ts 170.441;
|
||||
tranlib ( 0 136.5 3.33 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1314,6 +1363,7 @@ C3H7
|
|||
{
|
||||
As 9.40481e-07;
|
||||
Ts 300.719;
|
||||
tranlib ( 2 266.8 4.982 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1338,6 +1388,7 @@ C3H8
|
|||
As 9.51417e-07;
|
||||
Ts 300.719;
|
||||
dipolePolarizability 5.819;
|
||||
tranlib ( 2 266.8 4.982 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1366,6 +1417,7 @@ CH2CHO
|
|||
diameter 3.97;
|
||||
dipoleMoment 0;
|
||||
dipolePolarizability 3.987;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1394,6 +1446,7 @@ CH3CHO
|
|||
diameter 3.97;
|
||||
dipoleMoment 2.69;
|
||||
dipolePolarizability 4.13;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1419,6 +1472,7 @@ HCO+
|
|||
Ts 492.739;
|
||||
rotationalRelaxation 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.356;
|
||||
tranlib ( 1 498 3.59 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1444,6 +1498,7 @@ H3O+
|
|||
Ts 745.739;
|
||||
rotationalRelaxation 10;
|
||||
dipolePolarizability 0.897;
|
||||
tranlib ( 2 572.4 2.605 1.844 0 4 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1467,6 +1522,7 @@ E-
|
|||
{
|
||||
As 6.14325e-09;
|
||||
Ts 492.739;
|
||||
tranlib ( 0 498 3.59 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1492,6 +1548,7 @@ C2H3O+
|
|||
Ts 256.799;
|
||||
rotationalRelaxation 2;
|
||||
dipolePolarizability 3.141;
|
||||
tranlib ( 2 224.7 4.162 0 0 1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1517,6 +1574,7 @@ CH5O+
|
|||
Ts 444.65;
|
||||
rotationalRelaxation 2;
|
||||
dipolePolarizability 2.462;
|
||||
tranlib ( 2 417 3.69 1.7 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1542,6 +1600,7 @@ O2-
|
|||
Ts 146.524;
|
||||
rotationalRelaxation 3.8;
|
||||
dipolePolarizability 1.424;
|
||||
tranlib ( 1 107.4 3.458 0 1.6 3.8 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1567,6 +1626,7 @@ OH-
|
|||
Ts 127.828;
|
||||
rotationalRelaxation 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.258;
|
||||
tranlib ( 1 80 2.75 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1592,6 +1652,7 @@ CO3-
|
|||
Ts 453.172;
|
||||
rotationalRelaxation 0;
|
||||
dipolePolarizability 2.677;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1617,6 +1678,7 @@ CHO2-
|
|||
Ts 276.956;
|
||||
rotationalRelaxation 0;
|
||||
dipolePolarizability 3.345;
|
||||
tranlib ( 2 244 3.763 0 2.65 2.1 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1642,6 +1704,7 @@ O-
|
|||
Ts 127.828;
|
||||
rotationalRelaxation 0;
|
||||
dipolePolarizability 1.424;
|
||||
tranlib ( 0 80 2.75 0 0 0 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1670,6 +1733,7 @@ CH3CO
|
|||
diameter 3.97;
|
||||
dipoleMoment 2.8;
|
||||
dipolePolarizability 3.97;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1695,6 +1759,7 @@ CHO3-
|
|||
Ts 453.172;
|
||||
rotationalRelaxation 0;
|
||||
dipolePolarizability 3.712;
|
||||
tranlib ( 2 436 3.97 0 0 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
|
@ -1723,6 +1788,7 @@ C2H5OH
|
|||
diameter 3.69;
|
||||
dipoleMoment 1.69;
|
||||
dipolePolarizability 4.591;
|
||||
tranlib ( 2 417 3.69 1.69 5.11 2 );
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
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