[cantera]: cleaning up a small error thats been propagated through the code
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5298d6989c
commit
7075be19cd
13 changed files with 112 additions and 263 deletions
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@ -8,7 +8,7 @@ cc_sources = DenseMatrix.cpp funcs.cpp Func1.cpp ODE_integrators.cpp \
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SquareMatrix.cpp ResidJacEval.cpp NonlinearSolver.cpp \
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SquareMatrix.cpp ResidJacEval.cpp NonlinearSolver.cpp \
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CVodeInt.cpp
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CVodeInt.cpp
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AM_CPPFLAGS = -I../../../ -I$(top_builddir)/build/include/cantera
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AM_CPPFLAGS = -I../../../ -I$(top_builddir)/build/include/cantera -I$(top_builddir)/build/include/cantera/kernel
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AM_CXXFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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AM_CXXFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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lib_LTLIBRARIES = $(top_builddir)/build/lib/libctnumerics.la
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lib_LTLIBRARIES = $(top_builddir)/build/lib/libctnumerics.la
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@ -19,6 +19,10 @@
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#include "ct_defs.h"
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#include "ct_defs.h"
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typedef double doublereal;
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typedef int integer;
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typedef int ftnlen;
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//#include <vecLib/cblas.h>
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//#include <vecLib/cblas.h>
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// map BLAS names to names with or without a trailing underscore.
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// map BLAS names to names with or without a trailing underscore.
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@ -22,6 +22,7 @@
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using namespace std;
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using namespace std;
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#include "ctlapack.h"
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#include "ct_defs.h"
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#include "ct_defs.h"
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#include "ctexceptions.h"
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#include "ctexceptions.h"
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#include "stringUtils.h"
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#include "stringUtils.h"
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@ -9,6 +9,7 @@
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#endif
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#endif
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#include "sort.h"
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#include "sort.h"
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||||||
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#include "ctlapack.h"
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namespace Cantera {
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namespace Cantera {
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@ -89,11 +89,11 @@ AC_OUTPUT(Makefile \
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doxygen/Makefile \
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doxygen/Makefile \
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ext/Makefile \
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ext/Makefile \
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ext/tpx/Makefile \
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ext/tpx/Makefile \
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ext/math/Makefile \
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ext/blas/Makefile \
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ext/cvode/Makefile \
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ext/cvode/Makefile \
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ext/f2c_blas/Makefile \
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ext/f2c_lapack/Makefile \
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ext/f2c_lapack/Makefile \
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ext/f2c_libs/Makefile \
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ext/f2c_libs/Makefile \
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ext/f2c_math/Makefile \
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Cantera/Makefile \
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Cantera/Makefile \
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Cantera/user/Makefile \
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Cantera/user/Makefile \
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Cantera/src/Makefile \
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Cantera/src/Makefile \
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@ -1,2 +1,2 @@
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SUBDIRS = f2c_lapack tpx math cvode blas f2c_libs
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SUBDIRS = f2c_libs f2c_blas f2c_lapack f2c_math cvode tpx
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@ -1,11 +0,0 @@
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SET (F2C_BLAS_SRCS dasum.c daxpy.c dcabs1.c dcopy.c ddot.c
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dgbmv.c dgemm.c dgemv.c dger.c dnrm2.c drot.c drotg.c
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drotm.c drotmg.c dsbmv.c dscal.c dsdot.c dspmv.c dspr.c dspr2.c
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dswap.c dsymm.c dsymv.c dsyr.c dsyr2.c dsyr2k.c dsyrk.c dtbmv.c
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||||||
dtbsv.c dtpmv.c dtpsv.c dtrmm.c dtrmv.c dtrsm.c dtrsv.c
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||||||
dzasum.c dznrm2.c idamax.c lsame.c xerbla.c )
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INCLUDE_DIRECTORIES ( ${PROJECT_SOURCE_DIR}/ext/f2c_libs )
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ADD_LIBRARY(ctblas ${F2C_BLAS_SRCS})
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60
ext/f2c_blas/Makefile.am
Normal file
60
ext/f2c_blas/Makefile.am
Normal file
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@ -0,0 +1,60 @@
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cc_sources = \
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dasum.c \
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daxpy.c \
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dcabs1.c \
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dcopy.c \
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ddot.c \
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dgbmv.c \
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dgemm.c \
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dgemv.c \
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dger.c \
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dnrm2.c \
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drot.c \
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drotg.c \
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drotm.c \
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drotmg.c \
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dsbmv.c \
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dscal.c \
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|
dsdot.c \
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dspmv.c \
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|
dspr.c \
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|
dspr2.c \
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dswap.c \
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||||||
|
dsymm.c \
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dsymv.c \
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dsyr.c \
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|
dsyr2.c \
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|
dsyr2k.c \
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||||||
|
dsyrk.c \
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|
dtbmv.c \
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||||||
|
dtbsv.c \
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||||||
|
dtpmv.c \
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||||||
|
dtpsv.c \
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||||||
|
dtrmm.c \
|
||||||
|
dtrmv.c \
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||||||
|
dtrsm.c \
|
||||||
|
dtrsv.c \
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dzasum.c \
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|
dznrm2.c \
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idamax.c \
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lsame.c \
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xerbla.c
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h_sources = blaswrap.h
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AM_CPPFLAGS = -I../f2c_libs
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AM_CXXFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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AM_FCFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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||||||
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lib_LTLIBRARIES = $(top_builddir)/build/lib/libctblas.la
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library_includedir = $(top_builddir)/build/include
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library_include_HEADERS = $(h_sources)
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#-----------------------
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# Cantera Converters C/C++ library
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#-----------------------
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__top_builddir__build_lib_libctblas_la_LDFLAGS = $(all_libraries) -release $(GENERIC_RELEASE)
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__top_builddir__build_lib_libctblas_la_SOURCES = $(cc_sources) $(h_sources)
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CLEANFILES = *.o
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@ -1,126 +0,0 @@
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#/bin/sh
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#/bin/sh
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#
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# $Revision: 1.10 $
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# $Date: 2009/01/12 19:34:14 $
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#
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.SUFFIXES :
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.SUFFIXES : .c .d .o
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do_ranlib = @DO_RANLIB@
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PURIFY=@PURIFY@
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# the directory where the Cantera libraries are located
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CANTERA_LIBDIR=@buildlib@
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# the directory where Cantera include files may be found.
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CANTERA_INCDIR=@ctroot@/build/include/cantera
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# the C++ compiler
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CXX = @CXX@
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# the C compiler
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CC = @CC@
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# C++ compile flags
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PIC_FLAG=@PIC@
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CXX_FLAGS = @CXXFLAGS@ $(CXX_OPT) $(PIC_FLAG)
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# C compile flags
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CFLAGS = @CFLAGS@ $(CXX_OPT) $(PIC_FLAG)
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# Local include files
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CXX_INCLUDES=-I../f2c_libs
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# How to compile the dependency file
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.c.d:
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@CXX_DEPENDS@ $(CFLAGS) $(CXX_INCLUDES) $*.c > $*.d
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# How to compile a C file
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.c.o:
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$(PURIFY) @CC@ -c $< @DEFS@ $(CFLAGS) $(CXX_INCLUDES)
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# -----------------------------------------------
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BLASLIB = @buildlib@/libctblas.a
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all: $(BLASLIB)
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OBJS = \
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||||||
dasum.o \
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daxpy.o \
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||||||
dcabs1.o \
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||||||
dcopy.o \
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||||||
ddot.o \
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||||||
dgbmv.o \
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||||||
dgemm.o \
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|
||||||
dgemv.o \
|
|
||||||
dger.o \
|
|
||||||
dnrm2.o \
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|
||||||
drot.o \
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|
||||||
drotg.o \
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|
||||||
drotm.o \
|
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||||||
drotmg.o \
|
|
||||||
dsbmv.o \
|
|
||||||
dscal.o \
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|
||||||
dsdot.o \
|
|
||||||
dspmv.o \
|
|
||||||
dspr.o \
|
|
||||||
dspr2.o \
|
|
||||||
dswap.o \
|
|
||||||
dsymm.o \
|
|
||||||
dsymv.o \
|
|
||||||
dsyr.o \
|
|
||||||
dsyr2.o \
|
|
||||||
dsyr2k.o \
|
|
||||||
dsyrk.o \
|
|
||||||
dtbmv.o \
|
|
||||||
dtbsv.o \
|
|
||||||
dtpmv.o \
|
|
||||||
dtpsv.o \
|
|
||||||
dtrmm.o \
|
|
||||||
dtrmv.o \
|
|
||||||
dtrsm.o \
|
|
||||||
dtrsv.o \
|
|
||||||
dzasum.o \
|
|
||||||
dznrm2.o \
|
|
||||||
idamax.o \
|
|
||||||
lsame.o \
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||||||
xerbla.o
|
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||||||
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||||||
SRCS = $(OBJS:.o=.cpp)
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# List of dependency files to be created
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DEPENDS=$(OBJS:.o=.d)
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# rule to make library
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$(BLASLIB): $(OBJS)
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@ARCHIVE@ $(BLASLIB) $(OBJS) > /dev/null
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ifeq ($(do_ranlib),1)
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||||||
@RANLIB@ $(BLASLIB)
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||||||
endif
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# ------------------------------------------------
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# Utility Targets
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clean:
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$(RM) $(OBJS) $(BLASLIB) *.d .depends
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# depends target
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depends:
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||||||
$(RM) *.d .depends
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@MAKE@ .depends
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.depends: $(DEPENDS)
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cat *.d > .depends
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$(OBJS): Makefile
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ifeq ($(wildcard .depends), .depends)
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include .depends
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||||||
endif
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||||||
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@ -1,9 +0,0 @@
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||||||
SET ( CTMATH_SRCS mach.cpp ddaspk.c dgbefa.c dgbsl.c dgefa.c dgesl.c
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||||||
dp1vlu.c dpcoef.c dpolft.c fdump.c j4save.c pcoef.c polfit.c pvalue.c
|
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||||||
xercnt.c xerhlt.c xermsg.c xerprn.c xersve.c xgetua.c printstring.c)
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||||||
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||||||
INCLUDE_DIRECTORIES ( ${PROJECT_SOURCE_DIR}
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${PROJECT_SOURCE_DIR}/ext/f2c_libs )
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||||||
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||||||
ADD_LIBRARY( ctmath ${CTMATH_SRCS} )
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||||||
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||||||
41
ext/f2c_math/Makefile.am
Normal file
41
ext/f2c_math/Makefile.am
Normal file
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@ -0,0 +1,41 @@
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|
cc_sources = \
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|
mach.cpp \
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ddaspk.c \
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dgbefa.c \
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dgbsl.c \
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||||||
|
dgefa.c \
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||||||
|
dgesl.c \
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||||||
|
dp1vlu.c \
|
||||||
|
dpcoef.c \
|
||||||
|
dpolft.c \
|
||||||
|
fdump.c \
|
||||||
|
j4save.c \
|
||||||
|
pcoef.c \
|
||||||
|
polfit.c \
|
||||||
|
pvalue.c \
|
||||||
|
xercnt.c \
|
||||||
|
xerhlt.c \
|
||||||
|
xermsg.c \
|
||||||
|
xerprn.c \
|
||||||
|
xersve.c \
|
||||||
|
xgetua.c \
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||||||
|
printstring.c
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||||||
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||||||
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h_sources = cblas.h gmres.h mkl_cblas.h
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||||||
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AM_CPPFLAGS = -I../f2c_libs
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||||||
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AM_CXXFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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||||||
|
AM_FCFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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||||||
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||||||
|
lib_LTLIBRARIES = $(top_builddir)/build/lib/libctmath.la
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||||||
|
library_includedir = $(top_builddir)/build/include
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||||||
|
library_include_HEADERS = $(h_sources)
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||||||
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||||||
|
#-----------------------
|
||||||
|
# Cantera Converters C/C++ library
|
||||||
|
#-----------------------
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||||||
|
|
||||||
|
__top_builddir__build_lib_libctmath_la_LDFLAGS = $(all_libraries) -release $(GENERIC_RELEASE)
|
||||||
|
__top_builddir__build_lib_libctmath_la_SOURCES = $(cc_sources) $(h_sources)
|
||||||
|
|
||||||
|
CLEANFILES = *.o
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||||||
|
|
@ -1,112 +0,0 @@
|
||||||
#/bin/sh
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||||||
#
|
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||||||
# $Source: /cvsroot/cantera/cantera/ext/f2c_math/Makefile.in,v $
|
|
||||||
# $Author: hkmoffa $
|
|
||||||
# $Revision: 1.10 $
|
|
||||||
# $Date: 2008/12/30 21:49:42 $
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||||||
#
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||||||
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||||||
.SUFFIXES :
|
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||||||
.SUFFIXES : .c .cpp .d .o
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||||||
do_ranlib = @DO_RANLIB@
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||||||
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||||||
PURIFY=@PURIFY@
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||||||
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||||||
# the directory where the Cantera libraries are located
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||||||
CANTERA_LIBDIR=@buildlib@
|
|
||||||
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||||||
# the directory where Cantera include files may be found.
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|
||||||
CANTERA_INCDIR=@ctroot@/build/include/cantera
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||||||
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||||||
# the C++ compiler
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||||||
CXX = @CXX@
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||||||
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||||||
# the C compiler
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||||||
CC = @CC@
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||||||
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|
||||||
# C++ compile flags
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|
||||||
PIC_FLAG=@PIC@
|
|
||||||
CXX_FLAGS = @CXXFLAGS@ $(CXX_OPT) $(PIC_FLAG)
|
|
||||||
CFLAGS = @CFLAGS@ $(CXX_OPT) $(PIC_FLAG)
|
|
||||||
|
|
||||||
# Local include files
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||||||
CXX_INCLUDES=-I../f2c_libs
|
|
||||||
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||||||
# How to compile the dependency file
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||||||
.c.d:
|
|
||||||
@CXX_DEPENDS@ $(CFLAGS) $(CXX_INCLUDES) $*.c > $*.d
|
|
||||||
|
|
||||||
.cpp.d:
|
|
||||||
@CXX_DEPENDS@ $(CXX_FLAGS) $(CXX_INCLUDES) $*.cpp > $*.d
|
|
||||||
|
|
||||||
# How to compile a C file
|
|
||||||
.c.o:
|
|
||||||
$(PURIFY) @CC@ -c $< @DEFS@ $(CFLAGS) $(CXX_INCLUDES)
|
|
||||||
|
|
||||||
# How to compile a Cpp file
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|
||||||
.cpp.o:
|
|
||||||
$(PURIFY) @CXX@ -c $< @DEFS@ $(CXX_FLAGS) $(CXX_INCLUDES)
|
|
||||||
|
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||||||
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||||||
# -----------------------------------------------
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||||||
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||||||
LIB = @buildlib@/libctmath.a
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||||||
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||||||
all: $(LIB)
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||||||
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||||||
OBJS = \
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||||||
mach.o \
|
|
||||||
ddaspk.o \
|
|
||||||
dgbefa.o \
|
|
||||||
dgbsl.o \
|
|
||||||
dgefa.o \
|
|
||||||
dgesl.o \
|
|
||||||
dp1vlu.o \
|
|
||||||
dpcoef.o \
|
|
||||||
dpolft.o \
|
|
||||||
fdump.o \
|
|
||||||
j4save.o \
|
|
||||||
pcoef.o \
|
|
||||||
polfit.o \
|
|
||||||
pvalue.o \
|
|
||||||
xercnt.o \
|
|
||||||
xerhlt.o \
|
|
||||||
xermsg.o \
|
|
||||||
xerprn.o \
|
|
||||||
xersve.o \
|
|
||||||
xgetua.o \
|
|
||||||
printstring.o
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCS = $(OBJS:.o=.cpp)
|
|
||||||
|
|
||||||
# List of dependency files to be created
|
|
||||||
DEPENDS=$(OBJS:.o=.d)
|
|
||||||
|
|
||||||
# How to make the static library
|
|
||||||
$(LIB): $(OBJS)
|
|
||||||
@ARCHIVE@ $(LIB) $(OBJS)
|
|
||||||
ifeq ($(do_ranlib),1)
|
|
||||||
@RANLIB@ $(LIB)
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
|
|
||||||
# ------------------------------------------------
|
|
||||||
# Utility Targets
|
|
||||||
|
|
||||||
clean:
|
|
||||||
$(RM) $(OBJS) $(LIB) *.d .depends
|
|
||||||
|
|
||||||
# depends target
|
|
||||||
depends:
|
|
||||||
$(RM) *.d .depends
|
|
||||||
@MAKE@ .depends
|
|
||||||
|
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.depends: $(DEPENDS)
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cat *.d > .depends
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$(OBJS): Makefile
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ifeq ($(wildcard .depends), .depends)
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include .depends
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endif
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@ -7,7 +7,7 @@ AM_CXXFLAGS = $(AM_CPPFLAGS)
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LINK = -lctcxx -luser -loneD -lzeroD -lequil -lkinetics -ltransport -lthermo
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LINK = -lctcxx -luser -loneD -lzeroD -lequil -lkinetics -ltransport -lthermo
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LINK += -lctnumerics -lctmath -ltpx -lctspectra -lconverters -lctbase -lcvode
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LINK += -lctnumerics -lctmath -ltpx -lctspectra -lconverters -lctbase -lcvode
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LINK += -lctlapack -lctblas -lctf2c -lm -lstdc++
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LINK += -lctlapack -lctblas -lctf2c -lm -lstdc++
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AM_LDFLAGS = -L/workspace/src/cantera/pecos_autotools/build/lib/
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AM_LDFLAGS = -L$(top_builddir)/build/lib/
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LIBS = $(LINK)
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LIBS = $(LINK)
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bin_PROGRAMS = DH_graph_1
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bin_PROGRAMS = DH_graph_1
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